Setting up a functional MRI protocol at 11.7T with cryoprobe in mice
Date:
Abstract
Objectifs:
Élaborer un protocole d’IRM fonctionnelle d’écho de spin (SE) à 11.7 T avec cryoprobe permettant une étude précise de la connectivité fonctionnelle chez la souris, tout en maximisant le grand champ de vue.
Matériels et Méthodes:
Nous avons utilisé 17 souris mâles C57BI6, âgées de 2 à 4 mois, et acquis les données sur un scanner IRM 11.7 T équipé d’une cryoprobe. L’anesthésie a été induite avec 3% d’isoflurane, puis maintenue à 1% ou 1.5% (mélange air/oxygène 1:1, 1 L/min). Le protocole comprenait l’acquisition d’une référence anatomique (RARE) et de l’imagerie fonctionnelle (SE-EPI). Les paramètres des 3 protocoles de la séquence SE-EPI sont résumés dans le Tableau 1. Nous avons prétraité les données avec RABIES [1] et les avons analysées à l’aide d’une ICA (30 composantes). Nous avons comparé différents protocoles et niveaux d’anesthésie en analysant les composantes correspondant aux réseaux de connectivité fonctionnelle au repos déjà connus chez la souris, en particulier le réseau du mode par défaut et le réseau somato-moteur [2].
Tableau 1: Paramètres de la séquence SE-EPI testés
Résultats:
Pour la comparaison des protocoles, nous avons utilisé 4 souris du groupe A, 5 du groupe B et 4 du groupe C. Le groupe A présentait des composantes mieux structurées et moins bruitées et a été retenu. Concernant l’anesthésie, une comparaison entre 1% et 1.5% d’isoflurane, réalisée avec 8 souris du groupe A, a révélé une différence significative en termes d’intensité. Dans le groupe à 1.5%, nous avons détecté une seule composante correspondant à un réseau connu, avec une intensité nettement inférieure à celles obtenues avec 1% d’isoflurane, comme illustré dans la Figure 1.
Figure 1: Une composante du réseau somatomoteur. Gauche : 1% d’iso. Droite : 1.5% d’iso
Conclusion:
Le protocole optimal retenu repose sur l’utilisation de la séquence SE-EPI 1 segment TE = 20 ms et une anesthésie à 1% d’isoflurane. Nous utiliserons ce protocole pour étudier la connectivité fonctionnelle dans différents modèles murins de schizophrénie.
Références:
[1] Desrosiers-Grégoire G, et al. Nat Commun 15, 6708. [2] Grandjean J, et al. NeuroImage 205, 116278.